Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC84Q86UT8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC84Q86UT8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms