Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.7 ms