Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT25Q7Z3Z0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms