Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX6Q7RTT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX6Q7RTT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms