Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZD4Q76G19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZD4Q76G19 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms