Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP43Q70EL4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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