Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms