Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM43BQ6ZT52 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM43BQ6ZT52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM43BQ6ZT52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM43BQ6ZT52 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms