Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HRCT1Q6UXD1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HRCT1Q6UXD1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms