Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC171Q6TFL3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC171Q6TFL3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms