Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC137Q6PK04 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC137Q6PK04 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms