Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC27Q6P3X3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC27Q6P3X3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms