Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms