Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD54Q6NXT1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms