Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABLIM2Q6H8Q1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABLIM2Q6H8Q1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms