Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms