Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ANKRD40Q6AI12 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms