Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHEQ5VZ18 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHEQ5VZ18 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms