Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM29Q5VYK3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ECM29Q5VYK3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms