Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CHIC1Q5VXU3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CHIC1Q5VXU3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms