Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF6Q5VXH4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms