Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC38Q5VT99 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC38Q5VT99 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms