Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOGA3Q5TF21 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SOGA3Q5TF21 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SOGA3Q5TF21 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms