Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RSPH4AQ5TD94 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms