Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCH4

CYP4A22, Cytochrome P450 4A22, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A22Q5TCH4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A22Q5TCH4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A22Q5TCH4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms