Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms