Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C10orf55Q5SWW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C10orf55Q5SWW7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms