Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP188Q5SRE5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP188Q5SRE5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms