Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIA9

CBWD5, COBW domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD5Q5RIA9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBWD5Q5RIA9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD5Q5RIA9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms