Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO47Q5MNV8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO47Q5MNV8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms