Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPIN3Q5JUX0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPIN3Q5JUX0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms