Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC3H12AQ5D1E8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms