Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SDK2Q58EX2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms