Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KHDC3LQ587J8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KHDC3LQ587J8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms