Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1BQ53T94 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF1BQ53T94 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms