Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALFQ53S48 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALFQ53S48 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms