Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA3BQ502W6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA3BQ502W6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms