Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM259Q4ZIN3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM259Q4ZIN3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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