Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN20Q4JDL3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN20Q4JDL3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN20Q4JDL3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN20Q4JDL3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN20Q4JDL3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN20Q4JDL3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN20Q4JDL3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN20Q4JDL3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms