Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP221Q4G0U5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms