Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms