Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01559Q495D7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01559Q495D7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms