Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT71Q3SY84 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms