Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms