Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSPP1Q1MSJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms