Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTC4SQ16873 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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