Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NRF1Q16656 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NRF1Q16656 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRF1Q16656 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NRF1Q16656 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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NRF1Q16656 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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NRF1Q16656 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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NRF1Q16656 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NRF1Q16656 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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NRF1Q16656 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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NRF1Q16656 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRF1Q16656 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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