Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFIL3Q16649 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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NFIL3Q16649 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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NFIL3Q16649 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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