Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCAQ16586 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms