Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL23Q16540 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL23Q16540 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms